TÜBİTAK BİLGEM tarafından geliştirilen GÖKTÜRK-1 Uydusu Millî Kripto Alt Sistemi yer istasyonlarından uyduya gönderilecek komutların ve uydudan alınan yüksek çözünürlüklü görüntünün yer istasyonlarına güvenli iletimini sağlayan sistemdir.
Millî Kripto Alt Sistemi içinde uyduya ve yer istasyonlarına entegre edilmiş millî kripto cihazları ve ilişkili anahtar yönetim ve yükleme cihazları yer almaktadır. Geliştirilen tüm cihazların cihaz seviyesi kripto analiz, COMSEC ve TEMPEST onayları bulunmaktadır.
GÖKTÜRK-1 Uydusu Millî Kripto Alt Sistemi, GÖKTÜRK-1 Uydusunun fırlatıldığı Aralık 2016 tarihinden itibaren kullanılmakta olup bu sayede uyduya entegre edilmiş olan kripto cihazı bu alanda tarihçe kazanmış ilk millî ekipman olmuştur.